В полнометражном аниме «Школа под прицелом» рассказывается о жизни подростков в японской школе. Изначально главные герои жили обычной жизнью. Однако все кардинально изменилось, когда в их школе появился довольно странный ученик с телепатическими способностями. Сначала никто не верил в то, что он телепат. Но уже совсем скоро все узнают, что у него действительно есть необычные способности.
Парень старается использовать свой дар только во благо. Он быстро становится кумиром для многих учеников. Некоторые обращаются к нему за помощью, чтобы решить собственные проблемы. Однако это нравится далеко не всем ученикам. В школе образуется группа единомышленников, которые не хотят, чтобы вместе с ними учился этот странный парень. Они собираются сделать все возможное, чтобы его исключили из школы. При этом у новенького появляется много друзей, которые готовы защитить его. Так начинается настоящее противостояние между учениками. Школа поделилась на два лагеря. Никто из учеников даже не мог подумать, к каким последствиям может привести их ожесточенное противостояние.